Lehrplan

Biochemie 2 - Diese Vorlesung behandelt die Grundlagen des zellulären Stoffwechsels. Wir beginnen mit Enzymologie (katalytische Prinzipien, Kofaktoren, Enzymkinetik) und behandeln anschließend die wesentlichen Reaktionswege des Energiestoffwechsels sowie die Biosynthese einzelner Stoffklassen. Abschließend werden Perspektiven zur Arbeitsteilung der Organe und einfache Grundlagen der bioinformatischen Modellierung von Stoffwechselprozessen angesprochen.

Methoden der Biochemie 1 - Diese Vorlesung führt in die methodischen Grundlagen der Biochemie ein und ist Voraussetzung für das Biochemie Praktikum 1.

Biochemie 3 - Diese Vorlesung beschäftigt sich auf fortgeschrittenem Niveau mit Protein- und Nukleinsäuren-Biochemie. Wir behandeln Strukturbiologie, Enzymologie, Enzymkinetik, Kooperativität, Protein-Protein und Protein-Nukleinsäure Interaktionen, Membranproteine und molekulare Maschinen. Das Schwergewicht liegt weniger auf einer qualitativen und mehr auf einer quantitativen Betrachtung.

Biochemie 4 - Diese Vorlesung beschäftigt sich mit verschiedenen Aspekten der Zellbiochemie und beginnt mit einer Einführung in die Zellbiologie und ihre Methoden. Im weiteren besprechen wir Membranbiologie, Endozytose, Organellen, Signaltransduktionswege, das Zytoskelett und seine Funktion in intrazellulärem Transport und  Zellwanderung, Zellzyklus und -tod, sowie Zelladhäsion und -polarität.

Strukturbiologie 1 - Diese Vorlesung präsentiert moderne Aspekte der Strukturbiologie auf fortgeschrittenem Niveau. Die Vorlesung konzentriert sich auf Methoden, die die 3-dimensionale Struktur von Proteinen und Proteinkomplexen sichtbar macht, einschliesslich Röntgenstrukturanalyse und Elektronenmikroskopie.
Sie bereitet die Studierenden auf das nachfolgende Strukturbiologiepraktikum vor und ermöglicht ihnen, strukturbiologische Veröffentlichungen zu lesen und die zugrundeliegenden Techniken zu verstehen.

Aufbauend auf den im Biochemischen Praktikum 1 erlernten Grundtechniken sollen die Studierenden im Biochemischen Praktikum 2 fortgeschrittene Methoden kennenlernen. In der ersten Woche beschäftigen sie sich mit Aspekten der Proteinreinigung und Charakterisierung, während die zweite Woche einen Einblick in Untersuchungsmethoden zur Proteinfaltung vermittelt. Abschliessend werden in der dritten Woche quantitative Reportergenanalysen durchgeführt. Eine weiteres Ziel dieses Praktikums ist das Erlernen der wissenschaftlichen Dokumentation der Versuche in Form eines frei formulierten Protokolls.

Strukturbiologie Praktikum - In diesem Praktikum sollen die Studierenden die Kristallstrukturen zweier Proteine unter Verwendung von hochmodernen Computermethoden bestimmen. Sie führen einfache Kristallisationsversuche durch und analysieren eine Aminosäuresequenz mit bioinformatischen Methoden. Sie werden ein Röntgenbeugungsspektrum von einer Synchrotonquelle prozessieren und die Kristallstruktur mithilfe von MAD lösen.  Sie werden lernen, wie man Elektronendichtekarten inspiziert und interpretiert. Schliesslich werden sie eine zweite Kristallstruktur durch molecular replacement lösen, den gebundenen Liganden bauen und verfeinern, und schliesslich die Proteinstrukturen in Lösung durch SAXS analyse bestimmen.

Strukturbiologie 2 - In diesem Seminar wählen die Studierenden eine Originalveröffentlichung aus einer Liste von neueren strukturbiologischen Publikationen in Spitzenjournalen aus, die sie den anderen Teilnehmern vortragen. Hierbei sollen sie den wissenschaftlichen Hintergrund, die Resultate und die dabei angewandten Methoden erklären. Sie sollen die Veröffentlichung auch kritisch beleuchten, sowohl was seinen Einfluß auf das wissenschaftliche Feld anbelangt, wie auch im Hinblick auf potentielle Schwächen in der Methodik oder der Argumentation.

Molekulare Genetik - Die heutigen experimentellen Ansätze verwenden genetische Methoden, die weit über die Mendelschen Regeln hinausgehen. Wir besprechen die biologischen Fragestellungen, die mit den aktuellen Techniken der molekularen Genetik behandelt werden können. Dies beinhaltet die gezielte genetische Manipulation von Organismen, die molekulare Analyse von Phänotypen sowie Grundlagen der Epigenetik.